Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CHMP5Q9NZZ3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP5Q9NZZ3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms