Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LMCD1Q9NZU5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
LMCD1Q9NZU5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms