Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD4Q9NZQ9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
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TMOD4Q9NZQ9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
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TMOD4Q9NZQ9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
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TMOD4Q9NZQ9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
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TMOD4Q9NZQ9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD4Q9NZQ9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
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TMOD4Q9NZQ9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
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TMOD4Q9NZQ9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
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