Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

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Length 722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCKIPSDQ9NZQ3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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