Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MYOFQ9NZM1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYOFQ9NZM1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms