Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM53CQ9NYF3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM53CQ9NYF3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms