Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CWC25Q9NXE8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms