Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX61

TMEM161A, Transmembrane protein 161A, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM161AQ9NX61 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM161AQ9NX61 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM161AQ9NX61 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM161AQ9NX61 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM161AQ9NX61 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM161AQ9NX61 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM161AQ9NX61 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM161AQ9NX61 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM161AQ9NX61 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM161AQ9NX61 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM161AQ9NX61 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM161AQ9NX61 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM161AQ9NX61 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM161AQ9NX61 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM161AQ9NX61 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM161AQ9NX61 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM161AQ9NX61 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM161AQ9NX61 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM161AQ9NX61 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM161AQ9NX61 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM161AQ9NX61 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM161AQ9NX61 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM161AQ9NX61 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM161AQ9NX61 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM161AQ9NX61 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM161AQ9NX61 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM161AQ9NX61 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM161AQ9NX61 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM161AQ9NX61 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM161AQ9NX61 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM161AQ9NX61 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM161AQ9NX61 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM161AQ9NX61 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM161AQ9NX61 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM161AQ9NX61 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM161AQ9NX61 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms