Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD4Q9NVD3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms