Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV92

NDFIP2, NEDD4 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP2Q9NV92 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDFIP2Q9NV92 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms