Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP5S1Q9NUS5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms