Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUJ3

TCP11L1, T-complex protein 11-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1Q9NUJ3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCP11L1Q9NUJ3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms