Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLE3Q9NRF9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms