Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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CYLDQ9NQC7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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CYLDQ9NQC7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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CYLDQ9NQC7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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CYLDQ9NQC7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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CYLDQ9NQC7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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CYLDQ9NQC7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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CYLDQ9NQC7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYLDQ9NQC7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYLDQ9NQC7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
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