Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC2

KCNK9, Potassium channel subfamily K member 9, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK9Q9NPC2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNK9Q9NPC2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms