Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZCCHC17Q9NP64 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZCCHC17Q9NP64 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms