Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP08

HMX1, Homeobox protein HMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX1Q9NP08 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMX1Q9NP08 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HMX1Q9NP08 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms