Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC4Q9HBW1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4Q9HBW1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms