Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG4

ATP6V0A4, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0A4Q9HBG4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V0A4Q9HBG4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP6V0A4Q9HBG4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V0A4Q9HBG4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V0A4Q9HBG4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V0A4Q9HBG4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V0A4Q9HBG4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V0A4Q9HBG4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V0A4Q9HBG4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V0A4Q9HBG4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V0A4Q9HBG4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V0A4Q9HBG4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V0A4Q9HBG4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V0A4Q9HBG4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V0A4Q9HBG4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V0A4Q9HBG4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V0A4Q9HBG4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V0A4Q9HBG4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V0A4Q9HBG4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V0A4Q9HBG4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V0A4Q9HBG4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V0A4Q9HBG4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V0A4Q9HBG4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V0A4Q9HBG4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V0A4Q9HBG4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V0A4Q9HBG4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V0A4Q9HBG4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V0A4Q9HBG4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V0A4Q9HBG4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V0A4Q9HBG4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V0A4Q9HBG4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V0A4Q9HBG4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V0A4Q9HBG4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V0A4Q9HBG4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms