Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMURF2Q9HAU4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMURF2Q9HAU4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms