Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG4Q9H9E3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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