Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
SENP3Q9H4L4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
SENP3Q9H4L4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SENP3Q9H4L4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SENP3Q9H4L4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SENP3Q9H4L4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SENP3Q9H4L4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SENP3Q9H4L4 AC083964.1-201ENST00000607549 630 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
SENP3Q9H4L4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SENP3Q9H4L4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SENP3Q9H4L4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SENP3Q9H4L4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SENP3Q9H4L4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SENP3Q9H4L4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SENP3Q9H4L4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SENP3Q9H4L4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SENP3Q9H4L4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SENP3Q9H4L4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SENP3Q9H4L4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SENP3Q9H4L4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SENP3Q9H4L4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SENP3Q9H4L4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SENP3Q9H4L4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SENP3Q9H4L4 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SENP3Q9H4L4 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SENP3Q9H4L4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SENP3Q9H4L4 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SENP3Q9H4L4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SENP3Q9H4L4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SENP3Q9H4L4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SENP3Q9H4L4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SENP3Q9H4L4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms