Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIPK3Q9H422 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIPK3Q9H422 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIPK3Q9H422 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms