Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC113Q9H0I3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC113Q9H0I3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms