Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF3Q9H094 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF3Q9H094 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms