Protein–RNA interactions for Protein: Q9H009

NACA2, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACA2Q9H009 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NACA2Q9H009 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NACA2Q9H009 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NACA2Q9H009 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NACA2Q9H009 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NACA2Q9H009 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NACA2Q9H009 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NACA2Q9H009 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NACA2Q9H009 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NACA2Q9H009 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NACA2Q9H009 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NACA2Q9H009 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NACA2Q9H009 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NACA2Q9H009 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NACA2Q9H009 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NACA2Q9H009 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NACA2Q9H009 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NACA2Q9H009 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NACA2Q9H009 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NACA2Q9H009 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NACA2Q9H009 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NACA2Q9H009 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NACA2Q9H009 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NACA2Q9H009 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NACA2Q9H009 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NACA2Q9H009 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NACA2Q9H009 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NACA2Q9H009 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NACA2Q9H009 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NACA2Q9H009 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NACA2Q9H009 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NACA2Q9H009 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms