Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SENP6Q9GZR1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SENP6Q9GZR1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms