Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2J2Q9GZM3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2J2Q9GZM3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms