Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCO2Q9BYV7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms