Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NIFKQ9BYG3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms