Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC8Q9BY41 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms