Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SALL3Q9BXA9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SALL3Q9BXA9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SALL3Q9BXA9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms