Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWJ5

SF3B5, Splicing factor 3B subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B5Q9BWJ5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SF3B5Q9BWJ5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF3B5Q9BWJ5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms