Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PAGR1Q9BTK6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAGR1Q9BTK6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PAGR1Q9BTK6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms