Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNPY3Q9BT09 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY3Q9BT09 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms