Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTKNQ9BST9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms