Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SIKE1Q9BRV8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIKE1Q9BRV8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms