Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 SENP3-208ENST00000583277 1578 ntTSL 215.51■□□□□ 0.072e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 GALT-211ENST00000489643 2019 ntTSL 215.07■□□□□ 07e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 GALT-228ENST00000557706 1828 ntTSL 314.99□□□□□ -0.018e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 RPS6KB1-205ENST00000472940 2808 ntTSL 214.77□□□□□ -0.042e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 GALT-201ENST00000378842 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.137e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 FADS3-213ENST00000534426 558 ntTSL 413.64□□□□□ -0.232e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 NUP93-211ENST00000566315 589 ntTSL 413.35□□□□□ -0.272e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 GALT-216ENST00000554638 1712 ntTSL 512.94□□□□□ -0.347e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 RPS6KB1-202ENST00000393021 5479 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.382e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 NUP93-216ENST00000568283 584 ntTSL 411.14□□□□□ -0.632e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 CNOT9-202ENST00000295701 1126 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.642e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 GALT-219ENST00000555020 2566 ntTSL 210.94□□□□□ -0.667e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 NUP93-217ENST00000568656 592 ntTSL 410.63□□□□□ -0.712e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 LINC02405-202ENST00000540244 689 ntTSL 310.45□□□□□ -0.742e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 NUP93-212ENST00000566678 442 ntTSL 210.29□□□□□ -0.762e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 NUP93-214ENST00000567081 315 ntTSL 310.25□□□□□ -0.772e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 RPS6KB1-201ENST00000225577 5375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.782e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 NUP93-219ENST00000569595 590 ntTSL 410.14□□□□□ -0.792e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 LINC02405-203ENST00000546062 563 ntTSL 310.07□□□□□ -0.82e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 KATNBL1-216ENST00000561270 884 ntTSL 29.58□□□□□ -0.882e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 KATNBL1-205ENST00000558681 739 ntTSL 28.99□□□□□ -0.972e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 NUP93-215ENST00000567641 604 ntTSL 48.9□□□□□ -0.982e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 NUP93-213ENST00000566727 563 ntTSL 48.17□□□□□ -1.12e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 WASHC4-208ENST00000550053 5819 ntTSL 58.16□□□□□ -1.12e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.292e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 TAF1-209ENST00000463163 498 ntTSL 36.9□□□□□ -1.32e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 CNOT9-207ENST00000489687 288 ntTSL 36.74□□□□□ -1.332e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.342e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 PPFIA1-221ENST00000532443 587 ntTSL 46.27□□□□□ -1.411e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 MAPRE3-208ENST00000491354 486 ntTSL 56.22□□□□□ -1.412e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 LGR4-206ENST00000530658 553 ntTSL 45.91□□□□□ -1.462e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 TARS-211ENST00000509410 782 ntTSL 35.66□□□□□ -1.52e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 WASHC4-205ENST00000548195 576 ntTSL 45.53□□□□□ -1.522e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 RPS6KB1-210ENST00000587622 583 ntTSL 55.27□□□□□ -1.572e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 ZBTB41-202ENST00000467322 3779 ntTSL 22.77□□□□□ -1.972e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.32e-7■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 MAN2C1-238ENST00000568944 591 ntTSL 416.98■□□□□ 0.312e-6■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.378e-9■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 TMEM51-206ENST00000451326 766 ntTSL 316.48■□□□□ 0.238e-9■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.188e-9■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 AP1G2-229ENST00000557132 474 ntTSL 313.4□□□□□ -0.265e-13■■■■□ 26.5
BUD13Q9BRD0 AAAS-216ENST00000550033 900 ntTSL 318.88■□□□□ 0.611e-9■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 AAAS-212ENST00000548931 1075 ntTSL 513.94□□□□□ -0.181e-9■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 YEATS2-204ENST00000472593 5737 ntTSL 211.32□□□□□ -0.62e-6■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 DOCK6-203ENST00000585904 554 ntTSL 417.99■□□□□ 0.472e-7■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 DXO-212ENST00000491327 1395 ntTSL 519■□□□□ 0.633e-6■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 DXO-215ENST00000498357 1625 ntTSL 1 (best)18.92■□□□□ 0.623e-6■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.181e-7■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.731e-7■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 MBD6-212ENST00000552163 570 ntTSL 324.58■■□□□ 1.535e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 PCSK4-211ENST00000591303 537 ntTSL 323.79■■□□□ 1.45e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.35e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 PCSK4-205ENST00000586616 2855 ntTSL 223.13■■□□□ 1.295e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 RNF44-203ENST00000504434 785 ntTSL 222.52■■□□□ 1.25e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 RCN3-204ENST00000597801 549 ntTSL 522.44■■□□□ 1.185e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 PCSK4-207ENST00000588195 1806 ntTSL 221.96■■□□□ 1.115e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.15e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.071e-7■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 ZNF689-205ENST00000565710 602 ntTSL 221.57■■□□□ 1.045e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 MBD6-204ENST00000547545 1884 ntTSL 1 (best)20.94■□□□□ 0.945e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 MAD1L1-212ENST00000450235 850 ntTSL 319.96■□□□□ 0.795e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 SAP18-205ENST00000485646 804 ntTSL 219.79■□□□□ 0.765e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 DDX1-203ENST00000434671 500 ntTSL 419.51■□□□□ 0.715e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 RNF44-202ENST00000504160 887 ntTSL 319.42■□□□□ 0.75e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 PCSK4-203ENST00000586002 545 ntTSL 319.41■□□□□ 0.75e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 AC010186.2-202ENST00000545363 805 ntTSL 1 (best)19.37■□□□□ 0.691e-6■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.651e-6■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.646e-16■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 WASHC2C-205ENST00000420848 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 518.9■□□□□ 0.625e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 REXO5-210ENST00000566276 924 ntTSL 518.55■□□□□ 0.569e-7■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 VSIG10L-202ENST00000600663 2297 ntTSL 1 (best)18.35■□□□□ 0.535e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 RCN3-205ENST00000598833 607 ntTSL 318.18■□□□□ 0.55e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.56e-16■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.445e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 TRMT44-208ENST00000532477 1851 ntTSL 217.73■□□□□ 0.435e-7■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.435e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.435e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 HEMK1-202ENST00000424388 873 ntTSL 317.61■□□□□ 0.419e-7■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.385e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 PCSK4-202ENST00000441747 2641 ntTSL 217.35■□□□□ 0.375e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 PCSK4-210ENST00000591201 2358 ntTSL 517.25■□□□□ 0.355e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.356e-16■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.345e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.265e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.235e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 FAM45A-203ENST00000462327 2497 ntTSL 516.13■□□□□ 0.179e-7■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 REXO5-212ENST00000566993 2549 ntTSL 516.02■□□□□ 0.169e-7■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 01e-6■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -05e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.015e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.035e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.045e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.085e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 SAP18-208ENST00000621421 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.15e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 RPP30-209ENST00000487998 1466 ntTSL 514.3□□□□□ -0.125e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 SLC9A8-204ENST00000490250 4942 ntTSL 214.24□□□□□ -0.138e-8■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 RPP30-203ENST00000413330 1004 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.145e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.141e-6■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 CEP68-204ENST00000497039 2355 ntTSL 214.04□□□□□ -0.165e-10■■■■□ 26.4
BUD13Q9BRD0 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.169e-7■■■■□ 26.4
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