Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LPIN3Q9BQK8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms