Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3AQ99856 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms