Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL13Q99616 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms