Protein–RNA interactions for Protein: Q99612

KLF6, Krueppel-like factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF6Q99612 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF6Q99612 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF6Q99612 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms