Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK3

ZNF607, Zinc finger protein 607, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF607Q96SK3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF607Q96SK3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF607Q96SK3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms