Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLCC1Q96S66 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLCC1Q96S66 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms