Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UIMC1Q96RL1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UIMC1Q96RL1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms