Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCNAQ96QF7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNAQ96QF7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNAQ96QF7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms