Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC85AQ96PX6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC85AQ96PX6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC85AQ96PX6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms