Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIC6Q96NY7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms