Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TSNARE1Q96NA8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSNARE1Q96NA8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms