Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms